Quy hoạch Khu kinh tế Ninh Cơ xác định ba phân vùng chức năng, ba trung tâm động lực và các trục kết nối giao thông nhằm khai thác tiềm năng kinh tế biển, đồng thời tăng cường liên kết vùng.
Khu kinh tế Ninh Cơ, quy mô khoảng 13.950 ha, được định hướng phát triển thành trung tâm công nghiệp, cảng biển, logistics và đô thị dịch vụ của Ninh Bình.