Trước khi nhà máy nước mặt sông Đuống tổ chức lễ khánh thành giai đoạn I, Cục Giám định Nhà nước về chất lượng công trình xây dựng (Bộ Xây dựng) đã đề nghị UBND TP Hà Nội cân nhắc việc tổ chức khánh thành công trình này do chưa đủ điều kiện nghiệm thu đưa vào khai thác, sử dụng.
Có 1 số thông tin cho rằng, nhà máy nước sông Đuống - giai đoạn 1 chưa đủ điều kiện nghiệm thu đã đưa vào khai thác, sử dụng.
Ngày 30/8/2019, Cục Giám định Nhà nước về Chất lượng công trình xây dựng thuộc Bộ Xây Dựng đã có công văn số 447/GĐ-GĐ3 gửi UBND TP.Hà Nội về công trình nhà máy nước mặt sông Đuống giai đoạn 1 chưa đủ điều kiện nghiệm thu đưa vào khai thác sử dụng. Hiện tại, nhà máy này đã được khánh thành và cấp phát nước cho người dân.