Dù đã đạt được một số kết quả nhất định, song việc chuyển đổi số tại các bệnh viện ở TP.HCM vẫn còn chậm và nhiều khó khăn. Nguyên nhân có nhiều, nhưng cốt lõi là thiếu kinh phí và nhân lực chuyên trách để vận hành hệ thống.
Việc chuyển đổi số tại các bệnh viện còn gặp khó khăn bởi khó đảm bảo an toàn, bảo mật thông tin của người bệnh khi thực hiện khám bệnh hay tư vấn trực tuyến.