Tất cả hoạt động nghiệp vụ và các khâu quản lý nhà nước của Cục Hải quan Hà Tĩnh đều đã được tin học hóa và thực hiện bằng phương pháp điện tử để tạo thuận lợi cho doanh nghiệp, tăng thu ngân sách nhà nước.
Trong hành trình đổi mới, hội nhập của đất nước, đặc biệt trong giai đoạn 2015 - 2020, Cục Hải quan Thanh Hóa đã có những nỗ lực trong quản lý nhà nước về xuất nhập cảnh, bảo vệ lợi ích chủ quyền quốc gia; cải cách hiện đại hóa, tạo thuận lợi cho xuất nhập khẩu, thu ngân sách...