Sau kết luận của Thanh tra TP Hồ Chí Minh về vấn đề quản lý tiền trợ giá đối với xe buýt vào năm 2016, Sở GTVT thành phố đã yêu cầu Trung tâm Quản lý giao thông công cộng khẩn trương rà soát hồ sơ quyết toán tiền trợ giá đối với xe buýt của các đơn vị vận tải; thuê đơn vị kiểm toán độc lập để kiểm toán lại toàn bộ số liệu quyết toán kinh phí trợ giá cho xe buýt đã kéo dài từ năm 2011 đến khi đó.