Với bề dày hơn 50 năm hình thành và phát triển, Trường THPT Phú Quốc đang từng bước khẳng định vai trò là một trong những cơ sở giáo dục quy mô lớn trên địa bàn đặc khu Phú Quốc. Không chỉ chú trọng nâng cao chất lượng dạy và học, nhà trường đang đẩy mạnh chuyển đổi số, giáo dục STEM, ngoại ngữ, hướng nghiệp và phát triển kỹ năng cho học sinh, qua đó góp phần chuẩn bị nguồn nhân lực đáp ứng yêu cầu phát triển mới của địa phương.