Tạo thuận lợi tối đa cho hoạt động xuất khẩu, nhập khẩu nhưng đồng thời cũng giám sát, quản lý chặt chẽ, đảm bảo nguồn thu cho ngân sách Nhà nước; chống buôn lậu gian lận thương mại, làm tốt công tác thống kê và hợp tác quốc tế, là nhiệm vụ đã được Cục Hải quan Thanh Hóa hoàn thành xuất sắc trong suốt chặng đường 75 năm xây dựng và trưởng thành. Qua từng chặng đường lịch sử đầy gian lao, thử thách nhưng cũng rất đỗi vinh quang, các thế hệ cán bộ, công chức Hải quan Thanh Hóa luôn bám sát nhiệm vụ của ngành, các chủ trương, đường lối, chính sách của Đảng và Nhà nước, hoàn thành xuất sắc mọi nhiệm vụ được giao, góp phần đảm bảo lợi ích kinh tế quốc gia, thúc đẩy phát triển kinh tế - xã hội của tỉnh.