Hoạt động của các HTX tại tỉnh Gia Lai đang đối mặt với không ít khó khăn, vướng mắc như chưa có đất để xây dựng trụ sở, hạ tầng sản xuất; khó tiếp cận các nguồn vốn vay ưu đãi; gặp khó khăn về đầu ra cho sản phẩm; thiếu nhân lực trẻ có chuyên môn vững; trình độ, năng lực cán bộ quản lý chưa đáp ứng được yêu cầu thực tế công việc...