Phương án đầu tư theo hình thức PPP đối với cao tốc Mộc Châu - Sơn La - Điện Biên được đánh giá kém hấp dẫn khi nhu cầu vận tải còn thấp, tổng mức đầu tư lớn và thời gian hoàn vốn kéo dài trên 40 năm.