Với vai trò lãnh đạo, Trường đã chỉ đạo cho cấp dưới lập chứng từ duyệt chi sai quy định, gây thiệt hại hàng trăm triệu đồng.
Trong thời gian làm Giám đốc Trại giống Nông nghiệp, Trường để xảy ra nhiều vi phạm tài chính, tham ô tài sản, gây thiệt hại ngân sách nhà nước.