Phân bón giả có thể khiến cây thiếu dinh dưỡng, giảm năng suất; nếu chứa chất gây hại, hậu quả còn ảnh hưởng đến bộ rễ và đất trồng. Tuy nhiên, không thể chỉ nhìn màu hạt phân, hòa vào nước hoặc thấy cây vàng lá để kết luận đã mua phải phân giả.