Hệ thống y tế gặp khó khăn nghiêm trọng do thiếu trang thiết bị cần thiết cùng với sự xuất hiện của những biến chủng mới nguy hiểm hơn đã khiến tỷ lệ tử vong do Covid-19 tại châu Phi lên trên mức trung bình toàn cầu. Tổ chức Y tế thế giới (WHO) đã cảnh báo rằng, biến chủng mới của vi rút SARS-CoV-2 đang lây lan có thể khiến làn sóng dịch thứ hai tại Lục địa đen kéo dài, kéo theo nguy cơ làm tê liệt hệ thống y tế vốn đã mong manh tại châu lục 1,3 tỷ dân này.