Cuộc kiểm toán của Cơ quan Kiểm toán Quốc gia Australia (ANAO) cho thấy Bộ Nông nghiệp, Thủy sản và Lâm nghiệp (DAFF) mới chỉ quản lý một phần hiệu quả cơ chế thu hồi chi phí an toàn sinh học. Dù đã xây dựng mô hình tính phí và điều chỉnh cơ chế thu hồi chi phí từ năm 2023, Bộ vẫn chưa chứng minh được các mức phí phản ánh đúng chi phí thực tế, đồng thời còn tồn tại nhiều hạn chế trong định giá và quản lý rủi ro.