Hiện trường Tiểu học Võ Thị Sáu đang hoạt động dạy và học tại 2 địa điểm thuộc 2 phường Hàng Bài và Phan Chu Trinh, quận Hoàn Kiếm Hà Nội. Một địa điểm chung với hàng chục hộ dân, địa điểm còn lại nằm dưới một ngôi chùa.
Dự án xây dựng Trường Tiểu học Võ Thị Sáu mới tại khu đất 43F-47C phố Ngô Quyền và 36A phố Trần Hưng Đạo đến nay vẫn chưa được triển khai. Đây là một dự án chuyển tiếp, kéo dài hơn 30 năm với nhiều lần thay đổi chủ trương đầu tư.