Cơn bão số 2 làm xáo trộn tầng đáy cộng thêm trầm tích hữu cơ tích tụ do chất thải nuôi trồng nên các loại khí độc ở tầng đáy thoát ra, tảo độc phát triển làm tôm cá chết đột ngột do thiếu oxy.