Trước yêu cầu quản lý, bảo vệ chủ quyền và thực thi pháp luật trên vùng biển được giao, Đảng ủy, Bộ tư lệnh Vùng Cảnh sát biển 3 xác định chống khai thác hải sản bất hợp pháp, không báo cáo và không theo quy định (IUU) là nhiệm vụ chính trị trọng tâm. Để hoàn thành tốt nhiệm vụ này, Bộ tư lệnh Vùng đã triển đồng bộ, quyết liệt nhiều biện pháp với phương châm phát hiện sớm, ngăn chặn từ xa, xử lý nghiêm, không để vùng trống, khoảng trống trách nhiệm.